Лабораторія органічного синтезу здійснює комплекс робіт з синтезу нових перспективних біоактивних агентів та реагентів для органічного синтезу, а також з додаткового очищення реактивів та розчинників для синтетичних робіт. Лабораторія обладнана сучасними приточно-витяжною вентиляційною системою та витяжними шафами виробництва НПП "Укроргсинтез" (Україна). В процесі наукових досліджень застосовуються: роторні випаровувачі HAHNVAPOR (Hahnshin S&T Co., Ltd, Південна Корея) та KNF RC 600 (KNF, Німеччина), лабораторна вакуумна система Ilmvac LVS 300 (Ilmvac GmbH,Німеччина), вакуумні насоси KNF Laboport N842.3FT.40.18 та Ilmvac МРС 201 Е (Ilmvac GmbH, Німеччина), автоматичний прилад для визначення температури плавлення MT-50 (Mettler Toledo, США) та прилад для визначення температури плавлення SMP-30 (Stuart Scientific, Велика Британія), електронні аналітичні ваги PA 214C (OHAUS, США), сушильна шафа СП-50 (Укроргсинтез, Україна), магнітні перемішувачі Daihan WiseStir MSH-20D (Daihan, Південна Корея), навісний перемішувач Daihan WiseStir HS-30D (Daihan, Південна Корея), лабораторні водяні бані з можливістю термостатування WNE 7 (Memmert, Німеччина), ультразвукова баня Sonorex Super RK 510H (Bandelin, Німеччина.